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Centro
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- Litoral Aveiro
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- Litoral Figueira da Foz - Nazaré
EMN
- Estuário do Mondego
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- Ria de Aveiro, Triângulo das Correntes - Moacha
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RIAV3
- Ria de Aveiro, Canal Principal - Espinheiro
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Lisboa e Vale do Tejo
L5a
- Litoral Peniche - Cabo Raso
L5b
- Litoral Cabo Raso - Lagoa de Albufeira
ETJ1
- Estuário do Tejo, Jusante da Ponte Vasco da Gama
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- Estuário do Tejo, Montante da Ponte Vasco da Gama
LOB
- Lagoa de Óbidos
Alentejo
L6
- Litoral Setúbal - Sines
EMR
- Estuário do Rio Mira
ESD1
- Estuário do Sado, Esteiro da Marateca
ESD2
- Estuário do Sado, Canal de Alcácer
LAL
- Lagoa de Albufeira
Algarve
L7a
- Litoral Aljezur - S. Vicente
L7c1
- Litoral São Vicente -Lagos
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- Litoral Lagos -Albufeira
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- Litoral Faro - Olhão
L9
- Litoral Tavira – Vila Real Santo António
FAR1
- Ria Formosa, Faro, Cais Novo - Geada
FAR2
- Ria Formosa, Faro, Regato de Azeites - Barrinha
FUZ
- Ria Formosa, Fuzeta
GUA
- Rio Guadiana
LAG
- Ria de Alvor, Vale da Lama
OLH1
- Ria Formosa, Olhão
OLH2
- Ria Formosa, Olhão
OLH3
- Ria Formosa, Olhão
OLH4
- Ria Formosa, Olhão
OLH5
- Ria Formosa, Olhão
POR2
- Ria de Alvor, Povoação
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- Ria Formosa, Tavira
Portugal
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